На сегодняшний день действует 5 линий петербургского метро, эксплуатационная длина составляет 113,6 км. Количество станций — 67 (среди них 7 пересадочных узлов), 11 совмещено с вокзалами, железнодорожными станциями или платформами. В систему входят 72 вестибюля, 251 эскалатор и 856 турникетов. Имеется 5 эксплуатационных и одно ремонтное депо.
В 2013 году система перевезла 771,9 миллиона пассажиров, что ставит её на 17-е место в мире по уровню загруженности.
История сотрудничества компании ЭЛСИ с Санкт-Петербургским метрополитеном уходит в корнями 90е. В 1992 году АО ЭЛСИ разработала автоматизированную систему контроля оплаты проезда для Петербургского метрополитена с использованием магнитных карт. Это была первая система такого рода и уровня на просторах бывшего СССР. В настоящее время система внедрена в метрополитене в 72 станциях, информационно-вычислительном центре и в центре работы с льготными пассажирами, установлено более 770 турникетов типа трипод УТ-96М и оборудовано 300 автоматизированных рабочих мест кассира.
В 2003 году была внедрена обновленная система на оплату проезда по проездным билетам на основе бесконтактных смарт-карт.
В середине 2014 года АО «ЭЛСИ» оснастило объекты Санкт-Петербургского метрополитена «Автоматизированной системой контроля доступа на основе бесконтактных смарт-карт» (СКД - БСК). В настоящий момент системой СКД - БСК оснащены 70 станций Петербургского метрополитена и здание Управления.